共青團廣東省食品藥品監督管理局第一屆委員會于2006年9月選舉產生，并于2011年9月換屆選舉產生了第二屆委員會。現有在冊團員總數300多人，下設廣東省藥品檢驗所團總支、廣東省醫療器械質量監督檢驗所團總支、審評認證中心團總支、南方醫藥經濟研究所團總支、廣東省執業藥師注冊中心團支部、廣東省藥品不良反應監測中心團支部、廣東省食品檢驗所團支部等。在直屬機關黨委的領導和支持下，省局團委堅持團結奮發，圍繞食品藥品安全監管工作大局，明確定位，理清思路，情系民生，團結青年，服務公眾，開拓了團與青年工作的新局面，成績突出。近年來，先后榮獲全國青年文明號“突出貢獻青年文明號活動組織單位”、“廣東省五四紅旗團委”、第四屆“廣東志愿服務金銀銅獎”銀獎等國家級和省級榮譽，十多位同志被共青團廣東省委和省直團工委評為省級、省直“優秀團干部”、優秀共青團員。目前，省局機關及直屬單位已有國家級青年文明號1個，省級青年文明號2個，省直青年文明號5個，省局青年文明號3個。